1．黑斑病：主要危害叶片。发病初期，叶上出现褪绿的黄色病斑，后期呈圆形或不规则形，变褐色并有轮纹，边缘有时有黄绿色晕圈，上生黑色霉层，直径5～15毫米。严重时，病斑连成片，除叶脉外，全叶枯黄。此病是由真菌引起，雨季发生严重，荷塘或盆栽连作，以及氮肥施入过多或夏季水温过高等情况下，病害均很严重。防治方法：加强栽培管理，及时清除病叶。发病较严重的植株，需更换新土再行栽植，不偏施氮肥。发病时，可喷施75％的百菌清600～800倍液防治。
2．褐斑病：主要危害荷花叶片。在病叶上出现直径0.5～8毫米大小的圆形斑点，呈淡褐色至黄褐色，边缘颜色较深。病害后期，病斑上生出许多黑色小霉点。秋季多雨时发病较严重。病菌多在残体上越冬。防治方法：清除残叶，减少病源。发病严重的可喷施50％的多菌灵500倍液，或用80％的代森锌500～800倍液进行防治。
3．腐烂病：主要危害叶片、花梗和莲藕。危害叶片时，最初沿叶缘产生青枯色斑（块），不久病斑向叶内扩展，最后全叶变褐色而坏死。花梗发病时，沿着气孔线变褐色并凹陷。莲藕发病，先是变褐色，逐渐转向鞭节，纵向坏死，还可见到病藕节长出白色丝状物或粉红色的粉堆。此病通常在连作的情况下以及土壤贫瘠时发病较重，叶片若经常处在水浸的情况下，也容易发病。防治方法：适当施肥，注意水面不宜过高，以免浸泡叶片而导致发病。发现叶片上出现黑斑时及早摘除病叶，但叶片与叶柄连接处需保留，防止雨水由叶柄伤口侵入体内。喷施50％的多菌灵500倍液，或50％的疫霉净500倍液防治。
虫害
1．蚜虫：一般在5月上旬开始危害荷花的浮叶和小立叶，往往集中危害叶芽、花蕾及叶背等处，幼虫和成虫群集吸吮汁液，以春末及秋季危害最重。防治方法：可用20％的杀灭菊酯2000倍液。
2．大蓑蛾：主要危害立叶，严重时，荷叶背面可挂二三十只，它们将新老荷叶吃成千疮百孔，甚至全部吃光。防治方法：可用人工捕捉除治，及时摘去病叶。用90％的敌百虫1500～2000倍加青虫菌800倍液喷杀。清除藕田边的杂草，并进行消毒处理。
3．梨青刺蛾和褐刺蛾（俗名刺毛虫）:主要以幼虫危害立叶。一般从6月中旬到9月份危害。防治方法：摘除虫叶烧毁。用90％敌百虫800～1000液,或2.5％敌杀死3000倍液进行喷杀。
4．水蛆（地蛆）：幼虫在荷花的茎节和根上吮吸汁液，导致病叶发黄。防治方法：一般可用石灰驱杀。每667平方米（1亩）撒10～15千克，但不可过量。
5.荷缢管蚜：又称睡莲缢管蚜。主要危害荷花、睡莲、香蒲等，使植株生长不良、花蕾缩小、开花质量差以至不开花。防治方法：用50％灭蚜松乳油1000倍液喷施防治，或喷施50％双硫磷乳油2000倍液，该药对鱼类毒性小。对于水生植物上的蚜虫防治，选用药剂应特别注意，因为许多药剂对鱼类毒害很大。
6.斜纹夜蛾：又名莲纹夜蛾、斜纹夜盗。初卵幼虫群集在叶背啃食，只留上表皮和叶脉，被害叶好象纱窗一样。3龄后分散危害，将叶片吃成缺刻，发生多时可吃光叶片，甚至咬食幼嫩茎秆。大发生时幼虫吃光一田块后能成群迁移到邻近的田块危害。防治方法：国产B.t乳剂或青虫菌六号液剂500～800倍液进行喷杀；辛硫磷50%乳油1000倍液，或溴氰菊酯2.5%乳油3000倍液，或21%灭杀毙乳油4000倍液进行喷杀。