一忌与碱性肥料混施或同时施 碱性肥料包括草木灰、石灰、钙镁磷肥、钢渣磷肥等。如混尿素施或同时施，则会加剧尿素中的氮素变成氨而挥发。因此，夏秋季节，尿素与碱性肥应错开3至4天施用，冬春季节应错开7至8天。
二忌作种肥 尿素作种肥，由于集中的缩二脲的毒害作用会使种子失去发芽力，并危及幼苗。同时，因为高浓度的尿素能破坏种子的蛋白质结构，对种子也有毒害和抑制作用，故不宜作种肥。若必须作为种肥施用时，要避免种、肥接触，并控制用量。
三忌施后立即浇水 酰胺态的氮素，与土壤胶体间的吸附能力很低，其在土壤中的流动性和淋失性并不比硝态氮肥小。鉴于尿素的这些性能，追施尿素后，在其未转化完毕之前，切勿浇水，否则浪费大。一般夏秋季节应在施后2至3天浇水，冬春季节应在7至8天后浇水。，大雨之前不能施用尿素。
四忌浅施 尿素浅施养分易挥发，易被杂草消耗。尿素深施，融肥于土，使肥料处于湿润的土层中，有利于肥效的发挥。作追肥应穴施于苗旁或沟施在苗侧，深度也应在10至15厘米左右。这样，尿素通过移动大都能集中在根密集层，便于作物吸收利用。
五忌用量过大 尿素含氮量为44％至48％，养分含量高，施用量不宜过大，以免造成不必要的浪费和“肥害”。
六忌高浓度叶面喷施 叶面喷施切忌尿素溶液浓度过大，否则会烧坏叶片，也会毒害植株。园林绿化树木树以0.5％至1.5％为宜。
七忌施用过迟 尿素施用过晚，不利于肥效的发挥，故一般应比其他氮肥早施4至7天。
八忌单一施用 尿素要和有机肥及磷、钾肥等配合施用，以满足植物各种养分的需要。如尿素与过磷酸钙混合施用，可以使不稳定的硫酸氢铵转变为稳定的磷酸铵，可加速尿素的转化与分解，使可给态氮能迅速被作物吸收，提高尿素的利用率。