一、珠芽培育法
此法适用于产生珠芽的品种，如卷丹品种等。夏季采收成熟的珠芽，9月下旬～10月上旬，按行距12～15cm开4cm深的播种沟，沟内每4～6cm播珠芽1枚，播后覆土3cm左右。地冻前培土覆草盖膜，以利安全越冬。第2年春季出苗时揭除覆盖的草和膜，中耕除草，适当追肥浇水，促使秧苗旺盛生长。待到秋季地上部枯萎后挖取小鳞茎，然后按行距30cm、株距9～12cm播种，覆土厚约6cm，按上一年管理方法，再培育1年，秋季可收获达到标准大小的种球，部分未达标小鳞茎可继续培育。
二、小鳞茎培育法
此法适用于产生小鳞茎的品种，如天香百合品种等。秋季挖取可供食用的大鳞茎时，收集土中的小鳞茎，按珠芽培育法播种，因小鳞茎比珠芽大，故播种距离应比播珠芽稍大一些，经1年培育，大部分小鳞茎可达到种球标准，较小的鳞茎可继续培育。
三、鳞片扦插培育法
秋季或春季从充分成熟的鳞茎上选取发育良好的鳞片，用利刀将鳞片自基部切下，先在500倍苯菌灵溶液中浸30min杀菌，取出晾干后插播到沙壤土的苗床中。插鳞片时基部向下，入土深度达鳞片的1/2～2/3，片距4～5cm。插后立即遮荫，经常浇水保持土壤持水量75%，但床土不可过湿，以防鳞片腐烂。一般插后经15～20天，从鳞片下端的切口处长出1～2个胚球，以后生根长叶，适时追肥浇水，促进生长。秋季可形成玉米粒大小的小鳞茎，挖取后照珠芽培育法再播种培育一年能达到种球标准。
四、芯子培育法
此法适用于独头鳞茎品种。秋季采收有机百合时进行严格选择，淘汰病合、弱合和肉色异样的百合，选取发育良好的，剥去鳞茎中外层鳞片用于上市或加工，将剩下拇指粗的有机百合芯子与根盘作种球，在苗床培育1年，即可达到种球标准。
五、种子培育法
此法适用于能开花结实而产生种子的品种，如卷丹、山丹等品种。秋季采得成熟的种子，随即播入苗床土中。苗床土用中层菜园土4份加充分腐熟细碎的堆肥4份加细沙2份混合拌匀，平铺于苗床，厚约10cm。种子撒播后盖细土3cm，再覆草盖膜。选择秋季播种方式，种子可在冬季先发根，翌春出苗早且生长快，切记不要拖到第2年春季播种，否则出苗很迟且发芽率低。春季出苗后揭去膜和草，进行间苗，以后勤中耕除草，适时追肥，促进生长。等到秋季采收的鳞茎很小，须继续培育4～5年方可作为种球。